Winscp   es una genial aplicación que nos permite acceder a un server que soporte Ssh y ver los sistemas de archivos como si del norton Commander se tratase.

Entre las opciones que traen las últimas versiones está la de escribir sencillos scripts que permitan ejecutar acciones desde la línea de comando.

La verdad que es una muy buena opción para hacer backups remotos o sincronizar directorios remotos y locales.