Ubuntuzilla es un script que actualiza automáticamente  los productos de mozilla en ubuntu.

Despues de usarlo durante varios meses sin problema, al actualizar a la versión 3.05 de firefox el flash player dejó de existir.

No encontré solución en los foros así que busqué la manera (algo casera) de arreglarlo.

Ubuntuzilla hace backup de la carpeta de plugins en /opt/firefox/plugins<fecha>  así que solo hace falta mover el contenido de la carpeta a /opt/firefox/plugin
mv /opt/firefox/plugins /opt/firefox/plugins_backup
mv plugins_2009-01-11T03\:28\:25-0300 plugins

Reiniciamos firefox y todos los plugins están ahí.